Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gfra1P97785 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfra1P97785 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms