Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp4cP97470 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp4cP97470 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppp4cP97470 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms