Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nbr1P97432 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nbr1P97432 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nbr1P97432 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms