Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfrp2P97299 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfrp2P97299 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfrp2P97299 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms