Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim43bP86448 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim43bP86448 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms