Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cbx1P83917 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx1P83917 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx1P83917 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms