Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otx2P80206 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otx2P80206 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms