Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErfP70459 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErfP70459 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErfP70459 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErfP70459 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErfP70459 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErfP70459 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErfP70459 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErfP70459 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErfP70459 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ErfP70459 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ErfP70459 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ErfP70459 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ErfP70459 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ErfP70459 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms