Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rad50P70388 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad50P70388 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms