Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SeboxP70368 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeboxP70368 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeboxP70368 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeboxP70368 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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SeboxP70368 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SeboxP70368 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeboxP70368 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeboxP70368 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SeboxP70368 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeboxP70368 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SeboxP70368 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SeboxP70368 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeboxP70368 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SeboxP70368 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SeboxP70368 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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SeboxP70368 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SeboxP70368 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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