Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx3P70354 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx3P70354 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms