Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp3P70281 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sycp3P70281 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp3P70281 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms