Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3eP70275 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3eP70275 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms