Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdlim4P70271 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim4P70271 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms