Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Traf6P70196 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Traf6P70196 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Traf6P70196 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms