Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf5P70191 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf5P70191 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf5P70191 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms