Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capza3P70190 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capza3P70190 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capza3P70190 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Capza3P70190 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capza3P70190 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capza3P70190 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capza3P70190 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capza3P70190 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms