Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SbdsP70122 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SbdsP70122 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SbdsP70122 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms