Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2l3P68037 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2l3P68037 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms