Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk2bP67871 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2bP67871 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms