Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg2P63268 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg2P63268 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg2P63268 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg2P63268 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms