Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Actg1P63260 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actg1P63260 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms