Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcsk1P63239 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcsk1P63239 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk1P63239 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms