Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ElobP62869 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ElobP62869 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ElobP62869 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ElobP62869 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ElobP62869 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ElobP62869 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ElobP62869 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ElobP62869 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ElobP62869 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ElobP62869 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ElobP62869 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ElobP62869 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms