Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Acta2P62737 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Acta2P62737 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms