Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab11aP62492 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11aP62492 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms