Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tbpl1P62340 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tbpl1P62340 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms