Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lsm5P62322 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm5P62322 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms