Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps29P62274 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps29P62274 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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