Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnd3P61588 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnd3P61588 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnd3P61588 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms