Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf13P61216 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms