Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2kP61087 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2kP61087 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms