Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CirbpP60824 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CirbpP60824 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms