Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ActbP60710 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ActbP60710 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ActbP60710 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ActbP60710 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ActbP60710 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ActbP60710 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ActbP60710 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ActbP60710 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ActbP60710 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ActbP60710 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ActbP60710 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ActbP60710 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ActbP60710 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ActbP60710 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ActbP60710 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ActbP60710 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms