Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcbp1P60335 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms