Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcif1P59114 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcif1P59114 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcif1P59114 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms