Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csrnp1P59054 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrnp1P59054 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrnp1P59054 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms