Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxbp1P58501 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Paxbp1P58501 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms