Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Setd4P58467 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Setd4P58467 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Setd4P58467 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms