Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Opa1P58281 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opa1P58281 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opa1P58281 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Opa1P58281 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms