Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dpf3P58269 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms