Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smpdl3bP58242 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smpdl3bP58242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms