Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NcstnP57716 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NcstnP57716 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NcstnP57716 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NcstnP57716 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms