Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp2c39P56656 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2c39P56656 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2c39P56656 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms