Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TdgP56581 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TdgP56581 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TdgP56581 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TdgP56581 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TdgP56581 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TdgP56581 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TdgP56581 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TdgP56581 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TdgP56581 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TdgP56581 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TdgP56581 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TdgP56581 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TdgP56581 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TdgP56581 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms