Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lim2P56563 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lim2P56563 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lim2P56563 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms