Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf5P56477 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irf5P56477 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms