Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GferP56213 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GferP56213 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GferP56213 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GferP56213 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GferP56213 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GferP56213 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GferP56213 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GferP56213 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GferP56213 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GferP56213 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GferP56213 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms