Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acod1P54987 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acod1P54987 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms