Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nub1P54729 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nub1P54729 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nub1P54729 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nub1P54729 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nub1P54729 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nub1P54729 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nub1P54729 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nub1P54729 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nub1P54729 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms